Personal Data

Full name

Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Publishing name

Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Birthday

1972-04-25T00:00:00

Academic Degrees

DOUTORAMENTO(3)

Degree date

2004

Final grade

Aprovada com distinção e louvor

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Development of Statistical Methods for the Analysis of Molecular Genetic Data

Supervisor

Co-supervisor

Scientific area

Matemática - Probabilidades e Estatística

MESTRADO(3)

Degree date

1998

Final grade

Muito Bom

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Análise de Sobrevivência: Modelos Alternativos ao Modelo de Cox

Supervisor

Co-supervisor

Scientific area

Matemática - Probabilidades e Estatística

LICENCIATURA(5)

Degree date

1995

Final grade

16 valores (max: 20)

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Análise de Sobrevivência do Cancro do Colo do Útero

Supervisor

Co-supervisor

Scientific area

MAtemática - Probabilidades e Estatística

Profissional activity

Period Position Institution
From September 1995 to June 1997 Teaching Assistant Universidade Lusófona
From June 1997 to June 2004 Teaching Assistant Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências
Since June 2004 Assistant Professor Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências

Area of scientific activity

Area of scientific activity

Mathematics

Specialization domain

Probability and Statistics

Current main scientific area

Bioinformatics: Prediction of trnasmembrane protein topology; Detection of differencially expressed genes. Statistical methods for these studies: Bayesian Inference; Hidden Markov Models; Bayesian classification, EM algorithm.

Other scientific activities

Coordinator of the MSc. in Biostatistics, Faculty of Sciences - Lisbon University.
Co-responsable for the organization of the Workshop on Statistics in Genomics and Proteomics (Estoril - 2005). Co-responsable for the organization of the Workshop Statistical Modelling: Challenges in Health (May - 2010).

Experience as scientific advisor

Catarina Faria de Almeida, “Study of the Role of SETD2 Mutations in clear renal Cell Carcinoma (ccRCC)”. MSc Biostatistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, November 2013. Classif: 17 (max: 20).

Carina da Silva Fortes, “A Metodologia ROC na Analise de Dados de Microarrays”. PhD Thesis in Probability and Statistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, October 2012. Classif: Aprovada com Distinção e Louvor.

Mónica Seabra Eusébio, “Tratamento de Dados de NGS para Pesquisa de Novas Mutatações Associadas a Miocardiopatia Hipertrófica”. MSc Biostatistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, October 2012. Classif: 18 (max: 20).

Sara Duarte Ferreira Rabiais, “Meta-Análise: Uma Aplicação ao Estudo do Tratamento da Doença Pulmonar Obstrutiva Crónica”. Masters Dissertation in Biostatistics, MSc in Probability and Statistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, November 2011. Classif: 17 (max: 20).

Emiliano Barreto Hernández, “Statistical Methodologies for the Analysis and Normalization of RIP-CHIP Data”, October 2011. PhD Thesis in Biostatistics and Bioinformatics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, October 2011. Classif: Aprovado com Distinção.

Sílvia Rebouças, “Metodologias de Classificação Supervisionada para Análise de Dados de Microarrays”, PhD Thesis in Probability and Statistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, June 2011. Classif: Aprovado com Distinção e Louvor.

Sérgio Santos, "Desenvolvimento de Sistema on-line para a Predição da Topologia de Proteínas Transmembranares: Algoritmo BETH", MSc in Bioinformatics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, January 2009. Classif: Muito Bom (Very Good).

Rute Vieira, "Predição de Variantes Genéticas do VIH-1", MSc in Probability and Statistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, September 2008. Classif: 19 (max: 20).

Ana Rita Grosso, "New Insights in Alternative Splicing Using Microarray Platforms", MSc in Bioinformatics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa,
September 2006. Classif: Muito Bom (Very Good).

Paulo Dias, "Predição da Topologia de Proteínas Trasnsmembranares: Modelos de Markov Escondidos Não Homogéneos sob uma Perspectiva Bayesiana", MSc in Probability and Statistics, by Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa, May 2006. Classif: Muito Bom (Very Good).

Participations in R&D projects

FCT Strategic project: PEst-OE/MAT/UI0006/2011, member of the team.

FCT project: "Metodos Estatsticos em Processos Ambientais e Epidemiológicos", PTDC/MAT/118335/2010, member of the team.

FCT project: "Micorrhizal Symbiosis" SOBREIRO/0034/2009, no âmbito do "Cork Oak ESTs Consortium (COEC)", collaborator.

FCT project: "Statistical Methods in Genetics and Environment", PTDC/MAT/64353/2006, 2007-2010, member of the team.

FCT project: "Statistical Modelling of Environmental and Genetic Data", POCTI/MAT/44082/2002, 2003-2006, member of the team.

Awards

Year Award Awarding entity

Publications

Livros (editor)

  • Sousa,L. and Gonçalves,L. (2005). Workshop on Statistics in Genomics an Proteomics: Programme and Book of Abstracts, Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Clarke,L.A., Sousa,L., Barreto,C. e Amaral, M.D. (2013). Changes in transcriptome of native nasal epithelium expressing F508del-CFTR and intersecting data from comparable studies. Respiratory Research 14:38 (doi:10.1186/1465-9921-14-38)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Agudelo-Romero,P., Erban,A., Sousa,L., Pais,M.S., Kopka,J., Fortes,A.M. (2013). Search for transcriptional and metabolic markers of grape pre-ripening and ripening and insights into specific aroma development in three Portuguese cultivars. PLoS ONE 8(4): e60422. (doi:10.1371/journal.pone.0060422)

Livros (editor)

  • Sousa,L., Andreozzi,V., Antunes,M. and Gonçalves,L. (Eds), Special issue on “Statistical Modelling: Challenges in Health". REVSTAT Volume 9, Number 1, March 2011

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Fortes,A.M., Agudelo-Romero,P. Silva,M.S., Ali,K., Sousa,L., Maltese,F., Choi,Y.H., Grimplet,J., Martinez- Zapater,J.M., Verpoorte,R. and Pais,M.S. (2011). Transcript and metabolite analysis in Trincadeira cultivar reveals novel information regarding the dynamics of grape ripening. BMC Plant Biology. 11:149. (DOI:10.1186/1471-2229-11-149)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Sampaio,P.N., Sousa,L., Calado,C.R.C., Pais,M.S. and Fonseca,L.P. (2011). Application of chemometrics for selection the Saccharomyces cerevisiae expression system and culture medium composition for heterologous cyprosin B production. Biotechnology Letters 33: 2111-2119. (DOI 10.1007/s10529-011-0678-5)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Barreto-Hernandez,E., Gama-Carvalho,M. and Sousa,L. (2011). Pre-processing optimization of RNA immunoprecipitation microarray data. Journal of Computational Biology, 18(10): 1319-1328.(DOI: 10.1089/cmb.2010.0020)

Outras publicações

  • Rebouças,S., Sousa,L. and Pires,A. (2009). Metodologias de Classificação Supervisionada Para Análise de Dados de Microarrays. Notas e Comunicações CEAUL 26/2009.

Outras publicações

  • Barreto-Hernandez,E., Gama-Carvalho,M. and Sousa,L. (2009). Pre-processing Optimization of RNA Immunoprecipitation Microarry Data. Notas e Comunicações CEAUL 12/2009.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Silva-Fortes,C., Turkman,M.A. and Sousa,L. (2009). Avaliação da capacidade preditiva de testes de diagnóstico de cancro pancreático. In Estatística e Qualidade na Saúde: novos rumos novos desafios (Cunha, G. and Varanda, J. Eds. ) EQS2008, p. 161-169.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Sampaio,P., Calado,C., Sousa,L., Bressler,D., Pais,M.S., Fonseca,L. (2010). Optimization of the culture medium composition using response surface methodology for new recombinant cyprosin B production in bioreactor for cheese production. European Food Research and Technology 231: 339–346. (DOI: 10.1007/s00217-010-1281-z)

Livros (editor)

  • Antunes,M., Andreozzi,V., Sousa,L. and Gonçalves,L. (2010). StaM2010 - Statistical Modelling: Challenges in Health. Programme and Book of Abstracts, Centro de Estatística e Aplicações da Universidade de Lisboa.

Teses

  • Sousa, L. (2004). Development of Statistical Methods
    for the Analysis of Molecular Genetic Data. PhD Thesis. DEIO - Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Teses

  • Sousa, L. (1998). Análise de Sobrevivência: Modelos Alternativos ao Modelo de Cox. Masters Dissertation. DEIO - Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Sebastiana M., Figueiredo A., Acioli-Santos B., Sousa L., Pessoa F., Baldé A. and Pais M.S. (2009). Identification of plant genes involved on the initial contact between ectomycorrhizal symbionts (Castanea sativa - European chestnut and Pisolithus tinctorius). European Journal of Soil Biology 45: 275–282. (DOI:10.1016/j.ejsobi.2009.02.001)

Outras publicações

  • Antunes,M. and Sousa,L. (2008). Bayesian Classification and Non-Bayesian Label Estimation via EM Algorithm to Identify Differentially Expressed Genes: a Comparative Study. Notas e Comunicações CEAUL 6/2008.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Fortes,A.M., Santos,F., Choi,H.Y., Silva,M.S., Figueiredo,A., Sousa,L., Pessoa,F., Santos,B.A., Sebastiana,M., Palme,K., Malho,R., Verpoorte,R. and Pais,M.S. (2008). Organogenic nodule development in hop (Humulus lupulus L.): transcript and metabolic responses. BMC Genomics 9:445. (DOI:10.1186/1471-2164-9-445)

Publicações em actas de encontros científicos

  • Sousa,L. (2007). A Estatística ao Encontro da Genética. In Estatística e Qualidade na Saúde: Problemas e Temáticas, (Cunha and Varanda Eds.), EQS2006, p. 174-180.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Antunes,M. and Sousa,L. (2007). Classificação Bayesiana para Identificação de Genes com Expressão Diferencial. In Estatística Ciência Interdiscplinar: Actas do XIV Congresso Anual da SPE, (Ferrão et al. Eds.), Edições SPE, p. 217-224.

Livros (autor)

  • Fraga Alves,M.I., Gomes,M.I. and Sousa,L. (2007). Fundamentos e Metodologias da Estatística, Edições CEAUL.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Amaral,M.D., Clarke,A.C., Roxo-Rosa,M. and Sousa,L. (2006).<br>Genomic and proteomic approaches to study the genetic disease Cystic Fibrosis. In Proceedings of the Workshop on Statistics in Genomics and Proteomics (Urfer and Amaral Turkman Eds.), Edições CIM, p. 47-54.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Sousa,L., Santos,M., Amaral Turkman,M.A. and Urfer,W. (2003). As cadeias de Markov escondidas na identificação das proteínas transmembranares. In Literacia e Estatística (Brito et al. Eds.), Edições SPE, p. 651-658.

Outras publicações

  • Sousa, L., Santos, M. and Amaral Turkman,M.A. (2004). Bayesian estimation of transmembrane helices using hidden Markov models. Notas e Comunicações CEAUL 12/2004.

Outras publicações

  • Sousa,L., Santos,M., Amaral Turkman,M.A. and Urfer,W. (2002). Hidden Markov Models and Neural Networks: Identifying Signal Peptides and Transmembrane Protein Topology. Technical Report 27/2002, Dortmund University.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Figueiredo,A., Fortes,A.M., Ferreira,S., Sebastiana,M., Choi,Y.H., Sousa,L., Acioli-Santos,B.,Pessoa,F., Verpoorte,R. and Pais,M.S. (2008). Transcriptional and metabolic profiling ofgrape (Vitis vinifera L.) leaves unravel possible innate resistance against pathogenic fungi.Journal of Experimental Botany 59(12): 3371–3381. (DOI:10.1093/jxb/ern187)

Outras publicações

  • Sousa,L. (2009). Proteomics: predicting proteins structure. Em Book of Short Papers:
    Statistical Methods for the Analysis of Large Data-Sets, p. 207-210.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Figueiredo,A., Monteiro,F., Fortes,A.M., Bonow-Rex,M., Zyprian,E., Sousa,L. and Pais,M.S.
    (2012). Cultivar-specific kinetics of gene induction during downy mildew early infection
    in grapevine. Functional and Integrative Genomics 12(2), 379-386. (DOI:10.1007/s10142-
    012-0261-8)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Monteiro,F., Sebastiana,M., Figueiredo,A., Sousa,L., Cotrim,H.C. and Pais,M.S. (2012).
    Labellum transcriptome reveals alkene biosynthetic genes involved in orchid sexual deception
    and pollination-induced senescence. Functional and Integrative Genomics 12(4),
    693-703. (DOI:10.1007/s10142-012-0288-x)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Silva-Fortes,C., Amaral Turkman,M.A. and Sousa,L. (2012). Arrow Plot: a new graphical
    tool for selecting up and down regulated genes and genes differentially expressed on sample
    subgroups. BMC Bioinformatics 13:147. (DOI:10.1186/1471-2105-13-147)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Sousa,M., Servidoni,M.F., Vinagre,A.M., Ramalho,A.S., Bonadia,L.C., Felcio,V., Ribeiro,
    M.A., Uliyakina,I., Marson,F.A., Kmit,A., Cardoso,S.R., Ribeiro,J.D., Bertuzzo,C.S.,
    Sousa,L., Kunzelmann,K., Ribeiro,A.F. and Amaral,M.D. (2012). Measurements of CFTRmediated
    Cl2 secretion in human rectal biopsies constitute a robust biomarker for cystic fibrosis diagnosis and prognosis. PLOS ONE 7(10), e47708. (DOI:10.1371/journal.pone.0047708)

Publicações em actas de encontros científicos

  • Sousa,L. and Amaral Turkman,M.A. (1999). Um teste de ajustamento para o modelo de hazards proporcionais. In Afirmar a Estatística: Um Desafio para o Sec. XXI (Paulino et al. Eds.), Edições SPE, p. 379-384.

Teses

  • Sousa, L. (1995). Análise de Sobrevivência do Cancro do Colo do Útero. Diploma Dissertation. DEIO - Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Silva-Fortes,C., Hernandez,E.B., Sousa,L., Amaral Turkman,M.A. and Gama-Carvalho,M. (2008). Análise por microarrays de complexos ribonucleoproteicos: normalização e selecção de genes com associação diferencial. In Estatística, da Teoria à Prática: Actas do XV Congresso Anual da SPE (Hill et al. Eds.), Edições SPE, p. 537–547.

Outras publicações

  • Sousa,L., Althof,T., Raja,M.M., Kinne,R. and Urfer,W. (2004). Prediction of Nonhelical Intramembrane Segments in Membrane Proteins by a Bayesian Methodology. Technical Report 4/2004, Dortmund University.

Publicações em actas de encontros científicos

  • Silva-Fortes,C., Amaral Turkman,M.A. and Sousa,L. (2007). Aplicação das Curvas ROC em Dados de Microarrays. In Estatística e Qualidade na Saúde: Problemas e Temáticas,<br>(Cunha and Varanda Eds.), EQS2006, p. 15-21.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Acioli-Santos,B., Sebastiana,M., Pessoa,F., Sousa,L., Figueiredo,A., Fortes,A.M., Baldé,A.,Maia,L.C. and Pais,M.S. (2008). Fungal transcript pattern during the pre-infection stage(12h) of ectomycorrhiza formed between Pisolithus tinctorius and Castanea sativa roots,identified using cDNA microarrays. Current Microbiology 57: 620–625. (DOI:10.1007/s00284-008-9253-2)

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Antunes,M. and Sousa,L. (2008). Bayesian classification and non-Bayesian label estimation viaEM algorithm to identify differentially expressed genes: a comparative study. Biometrical Journal 50(5): 824–836. (DOI: 10.1002/bimj.200710468)

Outras publicações

  • Sousa,L., Santos,M., Amaral Turkman,M.A. and Urfer,W. (2001). Bayesian Analysis of Protein Sequence Data. Technical Report 48/2001, Dortmund University.

Communications

Outras comunicações orais

"Análise de Sobrevivência do Cancro do Colo do Útero", III Congresso da SPE, Guimarães - Portugal, 26-28 June 1995.

Comunicações em painel ("poster")

"Um Teste de Ajustamento para o Modelo de Hazards Proporcionais", VI Congresso da SPE, Tomar - Portugal, 9-12 June 1998.

Outras comunicações orais

"Identification of Signal Peptides Using a Hidden Markov Model: its Application to a Lytic Hydrolase of Biotechnological Importance", Annual Conference of The International Environmetrics Society - TIES2002, Genova - Italy, 18-22 June 2002.

Outras comunicações orais

"As Cadeias de Markov Escondidas na Identificação das Proteínas Transmembranares", X Congresso da SPE, Porto - Portugal, 25-28 September 2002.

Outras comunicações orais

"Identificação de Genes com Expressão Diferencial:<br>Abordagens Não Paramétrica e Bayesiana ", XII Congresso da SPE, Évora - Portugal, 29th September - 2nd October 2004.

Comunicações em painel ("poster")

"Bayesian Estimation of Hidden Markov Models to Predict Transmembrane Protein Topology", Theme Conference of the Royal Statistical Society - RSS2003, Hasselt - Belgium, 14-17 July 2003. (Also XI Congresso da SPE, Faro - Portugal, 24-27 September 2003)

Comunicações em painel ("poster")

"BETH - Bayesian Estimation of Transmembrane Helices",<br>ISBA 2004 World Meeting, Viña del Mar - Chile, 23-27 May 2004.

Comunicações orais por convite

"Alguns Métodos Estatísticos em Genética Molecular: Proteínas Transmembranares e Microarrays", Universidade de Lisboa - Portugal, June 15, 2005.

Comunicações em painel ("poster")

"Study of Molecular Mechanisms Involved in Downy Mildew Disease Desistance in Vitis ViniferaI Cultivars" e "Transcript Profiling with cDNA Microarrays Reveals Genes Involved in the First Hours of Plant-Fungus Contact in an Ectomycorrhizal Symbiosis", IV Plant Genomics European Meetings, Amsterdam - The Netherlands, 20-23 September 2005.

Comunicações em painel ("poster")

"Predição da Topologia de Proteínas Transmembranares: Modelos de Markov Escondidos não-Homogéneos numa Perspectiva Bayesiana", XIII SPE Annual Meeting, Peniche - Portugal, 28 September - 1 October 2005.

Comunicações em painel ("poster")

"Transcriptional profiling during organogenic nodule formation in hop". III EPSO Conference - Plant Dynamics: from Molecules to Ecosystems, Visegrád - Hungary, 28 May - 1 June 2006.

Comunicações orais por convite

"A Estatística ao Encontro da Genética", V Conferência Estatística e Qualidade na Saúde, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa, November 9-10, 2006.

Comunicações em painel ("poster")

"Classificação Bayesiana para Identificação de Genes com Expressão Diferencial", XIV Congresso Anual da SPE, Covilhã - Portugal, 28 September - 1 October 2006.

Comunicações em painel ("poster")

"Initial Cross-Talk Between Host and Endophyte in the Ectomycorrhizal Symbiosis", V Plant Genomics European Meetings, 11-14 October 2006, Venice, Italy.

Comunicações em painel ("poster")

"Aplicação das Curvas ROC em Dados de Microarrays", V Conferência Estatística e Qualidade na Saúde, Escola Superior de Tecnologia da Saúde de Lisboa - Portugal, 9-10 November 2006.

Outras comunicações orais

"Identification of Distinct Subset of Cellular mRNA Associated with Splicing Factors: Evaluation, Optimization of Normalization and Gene Selection Methods", WSGP Follow-Up Meeting, 9-10 March 2007, Coimbra - Portugal. (As co-author)<br>

Outras comunicações orais

"Normalização e Selecção de Genes Diferencialmente Expressos: mRNA Splicing Factors Microarrays". XV Congresso Anual da SPE, ISCTE, Lisboa, 19-21 August 2007. (As co-author)

Comunicações em painel ("poster")

"Let\'s ROC on Microarrays". 5th International Conference on Multiple Comparison Procedures - MCP2007, Vienna - Austria, 8-11 July 2007.

Comunicações em painel ("poster")

"Classification and Label Estimation via EM Algorithm: A Comparative Study". 5th International Conference on Multiple Comparison Procedures - MCP2007, Vienna - Austria, 8-11 July 2007.

Comunicações em painel ("poster")

"Grapevine leaves and mature berries analyzed by 1H NMR and by Principal Component Analysis and Partial Least Squares Discriminant Analysis coupled with non-parametric<br>statistical methods". GCB 2007 - 22nd German Conference on Bioinformatics. Potsdam - Germany, 26-28 September 2007.

Comunicações orais por convite

"Predição de Variantes Genéticas do Vírus da Sida". Dep. Estatística e Inv. Operacional - FCUL, December 15, 2006

Comunicações orais por convite

"A Estatística ao Encontro da Biologia Molecular", INESC-ID, January 25, 2007. (Also at Universidade do Minho - Portugal, July 14, 2006.)<br>

Outras comunicações orais

“HIV-1 Diversity, Phylogenetics and Relative Evolution Rate: Analysing Variability in Each Position of nef Gene”. COMPSTAT2008, Porto - Portugal, 24-29 August 2008. (As co-author)

Comunicações em painel ("poster")

“Bayesian Methods for Discovering Transcription-Factor Targets from RNA Immunoprecipitation Microarrays”. COMPSTAT2008, Porto - Portugal, 24-29 August 2008.

Comunicações em painel ("poster")

“Pre-processing Optimization of RNA Immunoprecipitation Microarray Data”. 5th annual RIB (Red Iberoamericana de Bioinformatica) conference, Santiago - Chile, 15–17 October 2008.

Comunicações em painel ("poster")

“Avaliação da Capacidade Preditiva de Testes de Diagnóstico de Cancro Pancreático”. VI Conferência Estatística e Qualidade na Saúde, Escola Superior de Tecnologia da<br>Saúde de Lisboa, 20–21 November 2008.

Comunicações orais por convite

“Proteomics: Predicting proteins structure”. SIS Meeting, Pescara - Italy, 23-25 September 2009.

Outras comunicações orais

"Statistical methodologies for RIP-Chip data analysis". XVII Congresso Anual da SPE, Sesimbra, Lisboa, 30 Sept - 3 October 2009. (As co-author)

Outras comunicações orais

"Identification of Differentially Expressed Genes: Two Bayesian Approaches ", Joint Statistical Meeting 2005, Minneapolis - EUA, 7-11 August 2005.

Outras comunicações orais

"Análise Bayesiana em Genética", I Congresso de Estatística e Investigação Operacional da Galiza e Norte de Portugal, Guimarães - Portugal, 26-28 October 2005. (As co-author)

Outras comunicações orais

"Some Methods for Identifying Differentially Expressed Genes", EMS Summer School - SemStat: Statistics in Genetics and Molecular Biology, Universidade de Warwick - UK, 10-16 September 2005.

Comunicações em painel ("poster")

Silva-Fortes, C., Amaral Turkman, M.A., Sousa, L. (2010). “Decision rule to obtain a convex curve to select up- and down-regulated genes in one channel microarrays”. StaM2010 – Statistical Modelling: Challenges in Health (Lisbon – Portugal, 9 – 12 May 2010).

Comunicações em painel ("poster")

Pedro, S., Sousa,L., Pires,A.M. (2010). “Classification of microarray data using logistic regression”. StaM2010 – Statistical Modelling: Challenges in Health (Lisbon – Portugal, 9 – 12 May 2010).

Comunicações em painel ("poster")

Antunes, M., Sousa, L. (2010). “EMB: A combination of EM-algorithm and Bayesian classification model for gene identification”. 9th Valencia International Meeting on Bayesian Statistics (Benidorm – Spain, 3 – 8 June 2010).

Comunicações em painel ("poster")

Silva-Fortes, C., Amaral Turkman, M.A., Sousa, L. (2010). “Comparison between Bayesian and Classical methodologies for discovering transcription-factor targets from RIP-chip experiments”. 9th Valencia International Meeting on Bayesian Statistics (Benidorm – Spain, 3 – 8 June 2010).

Comunicações em painel ("poster")

Pedro, S., Sousa,L., Pires,A.M. (2010). “Análise discriminante de dados de microarrays: regularização ou redução de dimensionalidade?”. XVIII Congresso Anual da SPE (São Pedro do Sul – Portugal, 29 September – 2 October 2010).

Outras comunicações orais

Pedro, S., Sousa,L., Pires,A.M. (2010). “Microarray data reduction and classification”. EURO 2010 – 24th European Conference on Operational Research (Lisbon - Portugal, 11-14 July 2010).

Outras comunicações orais

Silva-Fortes, C., Amaral Turkman, M.A., Sousa, L. (2010). “Regras de decisão para a obtenção de curvas ROC convexas em microarrays de um canal” . XVIII Congresso Anual da SPE (São Pedro do Sul – Portugal, 29 September – 2 October 2010)

Comunicações orais por convite

“Supervised and Unsupervised Classification in Microarray Data”. Workshop on Bio-Optimização: Técnicas de Optimização Aplicadas à Biologia (Hotel Quinta das Lágrimas, 25 de Junho, 2011, Coimbra, Portugal).

Outras comunicações orais

Silva-Fortes, C., Amaral Turkman, M.A., Sousa, L. (2011). “Afinal as curvas ROC degeneradas nem sempre "degeneram” . XVII Conferência Estatstica e Qualidade na Saude (Lisboa – Portugal, 19 – 20 May 2011).

Comunicações orais por convite

"Statistical Analysis of RIP-Chip Data: Identification of mRNAs Enriched by Immunoprecipitation", Invited session in Joint Meeting of the Y-BIS and jSPE, Lisboa - Portugal, 23 - 26 july 2012.

Outras comunicações orais

Sousa,L., Rial,T., Garca,E., Pinsach,P. and Villanueva C. (2012). Efeitos agudos de uma
sessão de Ginástica Abdominal Hipopressiva com base me diferentes parâmetros corporais.
XX Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Estatstica, Porto - Portugal, 26 - 29 September 2012.

Comunicações em painel ("poster")

Eusebio,M., Sousa,L. and Enguita,F.J. (2012). Tratamento de dados de NGS para pesquisa
de novas mutações associadas à Miocardiopatia Hipertrófica. Presented in XX Congresso
Anual da Sociedade Portuguesa de Estatstica, Porto - Portugal, 26 - 29 September
2012.

Outras comunicações orais

Silva-Fortes,C., Amaral Turkman,M.A. and Sousa,L. (2012). Um novo algoritmo para a
estimação do coeficiente de sobreposição pelo metodo do nucleo. XX Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Estatstica, Porto - Portugal, 26 - 29 September 2012.

Outras comunicações orais

Eusebio,M., Sousa,L. and Enguita,F.J. (2012). NGS data analysis: a tool in the search of
unkown mutations associated with Hypertrophic Cardiomyopathy. Joint Meeting of the Y-BIS and jSPE, Lisboa - Portugal, 23 - 26 de july 2012.

Outras comunicações orais

Reboucas,S.P., Pires,A.M. and Sousa,L. (2012). Data piling in high dimensional, low sample size data. Joint Meeting of the Y-BIS and jSPE, Lisboa - Portugal,
23 - 26 july 2012.

Comunicações em painel ("poster")

Silva-Fortes,C., Amaral Turkman,M.A. and Sousa,L. (2012). Selecting dierentially expressed
genes with hidden subclasses. Presented in 9th International Workshop on
Computational Systems Biology, Ulm - Germany, 4 - 6 june 2012.

Comunicações orais por convite

"A Universidade do Futuro: Uma Reflexão". Dia da FCUL, 19th april 2013.

Outras comunicações orais

Clarke,L.A., Sousa,L. and Amaral, M.D. (2013). Transcriptomics of native nasal epithelium expressing F508del-CFTR and intersecting data from comparable studies. 36th European Cystic Fibrosis Conference, Lisbon - Portugal, 12 - 15 June 2013.

Outras comunicações orais

Silva-Fortes,C., Amaral Turkman, M.A. and Sousa,L. (2013). Arrow plot: um novo gráfico para a seleção de genes em dados de microarrays. I Encontro Português de Biometria & I Encontro Luso-Galaico de Biometria, Braga - Portugal, 14 - 16 july 2013.

Comunicações em painel ("poster")

Almeida,C., Sousa,L. and Grosso, A.R. (2013). Análise de Dados de NGS para o Estudo da Expressão Diferencial de Mutações no Gene SETD2 das Células do Carcinoma Renal. I Encontro Português de Biometria & I Encontro Luso-Galaico de Biometria, Braga - Portugal, 14 - 16 july 2013.