Personal Data

Full name

Marília Cristina de Sousa Antunes

Publishing name

Marília Antunes

Birthday

1969-11-18T00:00:00

Academic Degrees

DOUTORAMENTO(0)

Degree date

2003

Final grade

Aprovado com Distinção e Louvor (maximum classification)

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Some problems in non-linear prediction

Supervisor

Kamil Feridun Turkman

Co-supervisor

-

Scientific area

Probability and Statistics

MESTRADO(1)

Degree date

1995

Final grade

Very Good

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Nevoeiro no aeroporto da Portela: modelação da duração

Supervisor

Kamil Feridun Turkman

Co-supervisor

-

Scientific area

Probability and Statistics

LICENCIATURA(5)

Degree date

1991

Final grade

16 (out of 20)

Degree granting institution

Universidade de Lisboa

School / College / Campus

Faculdade de Ciências

Thesis title

Nevoeiro: parâmetro de risco em aeroportos

Supervisor

Kamil Feridun Turkman

Co-supervisor

-

Scientific area

Probability and Statistics

Profissional activity

Period Position Institution
from 1992 September 1st to 1995 July 18th Teaching Assistant Faculty of Sciences, University of Lisbon
from 1995 July 19th to 2003 February 27th Senior Teaching Assistant Faculty of Sciences, University of Lisbon
from 2003 February 28th to present time Assistant Professor Faculty of Sciences, University of Lisbon

Area of scientific activity

Area of scientific activity

Probability and Statistics;

Specialization domain

Prediction in non-linear models. Optimal alarm systems and optimal screening. Bayesian Statistics.

Current main scientific area

Optimal screening procedures; Classification problems in gene expression microarray data; Bayesian statistics; Applications in Health.

Other scientific activities

Member of the organizing committee of STAM2010 (Statistical Modelling: Challenges in Health; http://stam2010.fc.ul.pt/);
Member of the scientific committee of Jornadas do Mar 2008, 2010, 2012;
Referee in the following publications:
1- Brazilian Journal of Probability and Statistics
2- Proceedings of the Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística. 2003, 2004, 2005,2006, 2007, 2008
3- Jornadas do Mar; Escola Naval. 2004,2006, 2008, 2010
Member of jury in 8 phD Thesis
Member of jury in 15 MsC Thesis.

Experience as scientific advisor

PhD Thesis:

Sandra Cristina de Faria Ramos, Métodos Estatísticos de Screening em Classificação Supervisionada, Ph.D. thesis, DEIO, FCUL, 2010, Professor Adjunto at ISEP, IPP.

MsC Thesis:

Bernardete Andrade Pinheiro. MSc in Biostatistics (Mestrado em Bioestatística), FCUL-UL, December 2013. Project dissertation: Análise dos fatores associados à utilização de cuidados de saúde por doentes hipertensos.

Sílvia Cristina Martins Mendonça. MSc in Biostatistics (Mestrado em Bioestatística), FCUL-UL, July 2013. Project dissertation (written in English): Maternal breastfeeding in Portugal: factors associated with the duration and premature cessation.

Marta Gonçalves Cruces Simão Portugal. MSc in Statistics and Operations Research (Mestrado em Estatística e Investigação Operacional), FCUL-UL, July 2013. Dissertation: Modelos Estatísticos para a Previsão de Inactividade de Pré-Pagos.

Nuno Henrique Silva Monteiro. MSc in Information Management (Mestrado em Gestão da Informação), FCUL-UL, November 2012. Dissertation: Modelo de Previsão de Churn em Clientes Empresariais com 1 a 5 serviços.

Luísa Moreira Sêco. MSc in Biostatistics (Mestrado em Bioestatística), FCUL-UL,
July 2012. Dissertation: Identificação de Genes Associados com o Potencial Invasivo de Streptococcus pneumoniae.

Marta Maria dos Santos Castel-Branco, Factores de Risco Associados à Prevalência de Salmonella em Bandos de Frangos Gallus Gallus em Portugal, 2009, Teaching Assistant at Universidade Lusófona.

Liliana Sofia Mendonça Cardoso, Classificação de Genes em Hibridação Genómica Comparativa de Estirpes de Streptococcus Pneumoniae, 2009, Student.

Artur Miguel Cordeiro Pereira, Factores que Determinam o Sucesso Escolar- um caso de estudo, 2009, Teacher.

Participations in R&D projects

PTDC/MAT/64353/2006 MEGA: Métodos Estatísticos em Genética e Ambiente
Statistical Methods in Genetics and Environment 01-09-2007 , 31-08-2010 . Member of team ( 50 %)

PEst-OE/MAT/UI0006/2011 Strategic Project - UI 6 - 2011-2012

PTDC/MAT/118335/2010 Métodos Estatísticos em Processos Ambientais e Epidemiológicos (Statistical Methods in Environmental and Epidemiological Processes).

PTDC/SAU-SAP/119199/2010 Novos arbovírus isolados em Portugal. Determinação do risco e potenciais aplicações em Saúde Pública. (New arboviruses isolated in Portugal. Risk assessment
and public health application).

FP7-ICT-2013-10 (Call (part) Identifier).Proposal Title: PERsonalised ICT Supported Service for Independent Living and Active Ageing. Proposal Number SEP-210082951. Proposal Acronym
PERSSILAA. Project Type CP-FP-INFSO.

Awards

Year Award Awarding entity
2013 Prémio Pfizer de Investigação Clínica 2013 Pfizer

Publications

Livros (editor)

  • StaM2010 - Statistical Modelling: Challenges in Health. Programme and Book of Abstracts.
    N. DL: 310390/10. ISBN: 978-989-8203-46-5

Livros (autor)

  • Bento Murteira, Marília Antunes. Probabilidades e Estatística, Vol. II. Escolar Editora, 2012.

    Bento Murteira, Marília Antunes. Probabilidades e Estatística, Vol. I. Escolar Editora, 2012.

Capítulos de livros

  • Nuno Cardoso, Mário J. Silva and Marília Antunes. Chapter: Validação estatística dos resultados do HAREM.2007. In "HAREM, a primeira avaliação conjunta de sistemas de reconhecimento de entidades mencionadas para português".<br>Editors: Diana Santos, Nuno Cardoso. Linguateca.

Publicações em actas de encontros científicos

  • MA. Amaral-Turkman, V. Andreozzi, S. Ramos, M. Antunes and K. F. Turkman (2012). Detection of infectious disease outbreak by an optimal Bayesian alarm system. Proceedings of the VI International Workshop on Spatio-Temporal Modelling. Guimarães, Portugal. 12-14 September 2012.

    Marta Castel-Branco, Marília Antunes, Andrea Cara d'Anjo e Fernando Bernardo. 2009. Factores de risco associados à prevalência de Salmonella em explorações de frangos destinados à produção de carne em Portugal. Actas do XVI Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística.

    Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman, Marília Antunes. Optimal Screening Methods in Gene Expression Profiles Classification. Revised Papers. Compstat 2008.

    Marília Antunes and Lisete Sousa. Classificação Bayesiana para identificação de genes com expressão diferencial. Actas do XIV Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística. 2007.

    M. Antunes, K. F. Turkman- Um Modelo Regido pelas Observações para precipitação. Literacia e Estatística -Actas do X Congresso anual da SPE,2002.

    A Bayesian Approach to Event Prediction (com Maria Antónia Amaral Turkman e K. F. Turkman). Proceedings of the #6 Conferência CEMAPRE, 2000.

    Marília (Antunes) Reis, K. F. Turkman. Estimação em Modelos BL(1,0,1,1) com Resíduos. Actas do VI Congresso anual da SPE, 1998.

    Marília (Antunes) Reis, K.F. Turkman. Modelos de Regime para Séries Temporais. Actas do IV Congresso Anual da SPE, 1996.

    Marília (Antunes) Reis. Duração de Períodos de Nevoeiro em Aeroportos: uma aplicação do modelo de hazards. Actas do II Congresso anual da SPE, 1994.

Artigos em revistas de circulação internacional com arbitragem científica

  • Sandra Garces, Marilia Antunes, Elizabeth Benito-Garcia, Jose Canas da Silva, Lucien Aarden, Jocelyne Demengeot Ann Rheum Dis published 11 May 2013, 10.1136/annrheumdis-2013-203296
    http://ard.bmj.com/cgi/content/abstract/annrheumdis-2013-203296v1?papetoc

    Marta Castel-Branco, Marília Antunes, Patrícia Inácio, Miguel Cardo. Risk Assessment on Campylobacter in Broiler Meat at Slaughter Level in Portugal. Advances in Regression, Survival Analysis, Extreme Values, Markov Processes and Other Statistical Applications
    Studies in Theoretical and Applied Statistics 2013, pp 121-129.

    Sandra Ramos, Maria Antónia Amaral Turkman, Marília Antunes. Semi-parametric Building of the Optimal Screening Region in Supervised Classification. Advances in Regression, Survival Analysis, Extreme Values, Markov Processes and Other Statistical Applications
    Studies in Theoretical and Applied Statistics 2013, pp 391-399.

    Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman, Marília Antunes. Bayesian classification for bivariate normal gene expression. Computational Statistics and Data Analysis 54 (2010). doi:10.1016/j.csda.2010.03.001

    Joana Chora, Tiago Matos, Jorge Martins, Marisa Alves, Susana Andrade, Luís Silva, Carlos Ribeiro, Marília Antunes, Maria Graça Fialho, Maria Helena Caria. dDFNB1-associated deafness in Portuguese cochlear implant users: Prevalence and impact on oral outcome. International Journal of Pediatric Otorhinolaryngology, 74 (2010) 1135–1139 doi:10.1016/j.ijporl.2010.06.014

    Marília Antunes and Lisete Sousa. Bayesian Classification and Non-Bayesian Label Estimation via EM Algorithm to Identify Differentially Expressed Genes: a Comparative Study. Biometrical Journal 50 (2008) 5, 824-836. DOI: 10.1002/bimj.200710468

    J.E.Fonseca et al. Contribution for new genetic markers of rheumatoid arthritis activity and severity:
    sequencing of the tumor necrosis factor-alpha gene promoter. Arthritis Research & Therapy 2007, 9:R37 (doi:10.1186/ar2173)

    M. Antunes, M. A. A. Turkman and K. F. Turkman : A Bayesian approach to event prediction. Journal of Time Series Analysis, Vol 24, No 6, November 2003. 631-646.

Teses

  • Some Problems in Non-Linear Prediction. PhD Thesis . University of Lisbon, Faculty of Sciences, 2002.<br><br>Nevoeiro no Aeroporto da Portela: modelação da duração. MSc Thesis, University of Lisbon, Faculty of Sciences, 1995. <br>

Outras publicações

  • Marília Antunes. Prospecção de Dados: princípios e métodos. Texto de apoio às aulas de CRM e Prospecção de Dados. N. DL: 305972/10. ISBN: 978-989-8203-45-8

    StaM2010 – Statistical Modelling: Challenges in Health. Programme and Book of Abstracts. N. DL: 310390/10. ISBN: 978-989-8203-46-5

Communications

Comunicações orais por convite

Marília Antunes, Patrícia de Zea Bermudez, M. Conceição Proença, M. Teresa Rebelo, M. João Alves, Hugo Osório. Modelção da abundância de Culex pipiens em Portugal. XXI Congresso Anual da SPE, Aveiro, 30 Novembro de 2013, Portugal.

M. Antunes, M.A. Amaral Turkman, K. F. Turkman and C. Catita, M.A. Horta. A non-homogeneous Markov spatial temporal model for
dengue occurrence. Statistical Modelling in Medical and Environmental Sciences, Portugal, October 3-4, 2013, Guimarães.

A non-homogeneous Markov spatial temporal model for dengue epidemics
Marília Antunes, Antónia Amaral Turkman, Kamil Feridun Turkman, Marcos Horta and Cristina Catita.
Seventh Workshop on Statistics, Mathematics and Computation Tomar, Portugal
WSMC7, May 28-29, 2013, Tomar

Marília Antunes, Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman. Nonparametric Bayesian Models in Screening Problems. 5-7 October 2012. 4th Iberian Mathematical Meeting. Valladolid, Spain.

Antónia Amaral Turkman (speaker), Sandra Ramos, Marília Antunes, Valeska Andreozzi. September, 1-3, 2011. Optimal Bayesian semiparametric alarm system for epidemiological data. Seventh Workshop on BAYESIAN INFERENCE IN STOCHASTIC PROCESSES, Universidad Carlos III de Madrid, Getafe, Spain.

EMB: a combination of EM-algorithm and Bayesian classification model for gene identification. IV-Workshop on Statistics, Mathematics and Computation.
Lisbon, 9-10 November 2009.

Sobre a não Linearidade e a não simplicidade do modelo bilinear simples - Seminários com Novos Doutores. Faculdade de Ciências da Universidade de Lisboa.
10 Dezembro 2003

“Optimal Alarm Systems for Autoregressive Processes – a Bayesian approach”, International Center in Mathematical Modelling in Physics,
Engineering and Cognitive Sciences. School of Mathematics and systems Engineering, University of Vaxjo, Sweden. Visitante de 11 a 13 de Junho, 2002.

#6 Conferência do CEMAPRE, Lisboa em Junho de 2000. “Bayesian Approach to Event Prediction”. (as Co-author)

Outras comunicações orais

Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman, Marília Antunes. Modelação flexível do problema de triagem. XXI Congresso Anual da SPE, Aveiro, 30 Novembro de 2013, Portugal.

M. Antunes, M.A. Amaral Turkman, K. F. Turkman and C. Catita, M.A. Horta. A non-homogeneous Markov spatial temporal model for dengue occurrence. I Encontro Português de Biometria I Encontro Luso-Galaico de Biometria, July 14-16, 2013, Braga, Portugal.

XVII Congresso Anual da SPE, 30 Set-3Out 2009. "Colheita de dados e especificações técnicas do estudo de base para a monitorização de Salmonella e Campylobacter em carne de aves - do planeamento à implementação. " Marília Antunes e Marta Castel-Branco.

ICSMRA 2007 - August 30. The use of Bayesian Hierarchical Models for Supervised Classification: an Application to Rheumatoid Arthritis.
Antunes, M., Andreozzi, V., Amaral-Turkman, MA., Fonseca, JE.

XII Congresso Anual da SPE, 29 Setembro a 1 de Outubro de 2004. "Sistemas de alarme óptimos para o modelo linear geral".

SPRUCE VI – International Conference, Lund, Suécia,15 a 19 de Junho de 2003.“An Optimal Alarm System for Ozone Levels Exceedances”.

X Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Porto, 25 a 28 de Setembro de 2002. “Um modelo regido pelas observações para dados de precipitação”.

IX Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Ponta Delgada, 4 a 7 de Novembro de 2001. “Sistemas de alarme óptimos na presença de experiências informativas incompletas”.

23rd European Meeting of Stisticians,Funchal, 13 a 19 de Agosto de 2002. “A Bayesian Approach to Optimal Alarm”.

VIII Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Peniche, 4 a 7 de Outubro de 2000. “Abordagem Bayesiana à Predição de Acontecimentos”.

VII Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Ofir, 14 a 16 de Outubro de 1999. “Um modelo hierárquico para dados de precipitação”.

1º Encontro em Modelação Estatística, Sesimbra, 27 e 28 de Fevereiro de 1998. “Modelos Não Lineares para Séries Temporais com Mudanças de Regime”.

VI Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Tomar, 9 a 12 de Junho de 1998. “Estimação em modelos BL(1,0,1,1) com resíduos exponenciais”.

IV Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Funchal, 9 a 15 de Junho de 1996. “Modelos de regime para séries temporais”.

II Congresso da Sociedade Portuguesa de Estatística, Luso, 20 a 23 de Junho de 1994. “Duração de Períodos de Nevoeiro em Aeroportos: uma aplicação do modelo de hazards proporcionais”.

Comunicações em painel ("poster")

Bernardete Pinheiro, Marília Antunes, Milene Fernandes. Análise longitudinal do número de consultas em doentes hipertensos. XXI Congresso Anual da SPE, Aveiro, 30 Novembro de 2013, Portugal.

Sílvia Mendonça, Marília Antunes, Violeta Alarcão, Rui Simões . Maternal breastfeeding in Portugal: factors associated with the duration and premature cessation. XXI Congresso Anual da SPE, Aveiro, 30 Novembro de 2013, Portugal.

D. Viriato, M. Antunes. Impact of value communication in decision making: an approach to the treatment of type 2 diabetes in Portugal. XXI Congresso Anual da SPE, Aveiro, 30 Novembro de 2013, Portugal.

D. Viriato, M. Antunes. Impact of value communication in decision making: an approach to the treatment of type 2 diabetes in Portugal. ISPOR 16th Annual European Congress. 2-6 November 2013. The Convention Centre Dublin, Dublin, Ireland.

Marília Antunes, Francisco Pinto. KBEMB: a distribution-free combination of EM algorithm and Bayesian approach for identification of differentially expressed genes. XX Congresso anual da
SPE. Porto, Portugal, 26-29 September 2012.

Ninth Valencia International Meeting on Bayesian Statistics, Spain 2010. A nonparametric approach for supervised classification based on pairs of covariates . Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman and Marília Antunes.

Ninth Valencia International Meeting on Bayesian Statistics, Spain 2010. EMB: a combination of EM-algorithm and Bayesian classification model for gene identification. Marília Antunes and Lisete Sousa.

StaM2010 - Statistical Modelling: Challenges in Health. Nonparametric Bayesian density estimation in supervised classification based on pairs of covariates. Sandra Ramos, Antónia amaral Turkman and Marília Antunes.

XVII Congresso Anual da SPE, 30 Set-3 Out 2009. "Prevalência de Salmonella e Campylobacter em carcaças de frango para consumo humano - a realidade portuguesa." Marta Castel-Branco , Marília Antunes.

Bayesian NonParametrics, 2009. "Semiparametric Bayesian approach to gene profile classification". Sandra Ramos, Antónia Amaral Turkman, Marília Antunes.

XVI Congresso Anual da SPE, 30 Set-3 Out 2009. "Avaliação dos factores de risco para a infecção por Salmonella spp. em bandos de frangos Gallus gallus." Marta Castel-Branco, Marília antunes, Andrea Cara D'Anjo.

Marilia Antunes and Lisete Sousa. Bayesian Classification and Label Estimation via EM Algorithm: a comparative study. 5th International Conference on Multiple Comparison Procedures. Vienna. 8-11 July 2007.

“Sequencing of the tumour necrosis factor alpha gene promoter – contribution for new genetic markers of rheumatoid arthritis activity and severity”. Cavaleiro J, Teles J, Sousa E, Canhão H, Mourão AF, Sobral M, Nero P, Saavedra MJ, Malcata A, Cruz M, Melo R, Braña A, Miranda L, Patto JV, Barcelos A, Canas da Silva J, Santos LM, Figueiredo G, Rodrigues M, Jesus H, Quintal A, Carvalho T, Amaral-Turkman MA, Andreozzi VL, Antunes M, Pereira da Silva JA, Branco J, Viana Queiroz M, Fonseca J.
(Submetido para apresentação no EULAR 2006, 21-24 Junho, Amesterdão)

XIII Congresso Português de Reumatologia, 27-29 Abril 2006, Ponta Delgada. "Sequenciação da região do promotor do gene do factor de necrose tumoral alfa - contribuição para novos marcadores genéticos de actividade e gravidade da Artrite Reumatóide." Cavaleiro J, Teles J, Sousa E, Canhão H, Mourão AF, Sobral M, Nero P, Saavedra MJ, Malcata A, Cruz M, Melo R, Braña A, Miranda L, Patto JV, Barcelos A, Canas da Silva J, Santos LM, Figueiredo G, Rodrigues M, Jesus H, Quintal A, Carvalho T, Amaral-Turkman MA, Andreozzi VL, Antunes M, Pereira da Silva JA, Branco J, Viana Queiroz M, Fonseca J.

Marília Antunes, Lisete Sousa. Classificação bayesiana para identificação de genes com expressão diferencial. XIV Congresso Anual da Sociedade Portuguesa de Estatística. 27-30/09/2006.